MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 1126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	A	7	7	16	22	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012185	TTTA	2	8	61	68	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012185	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012185	ATGT	2	8	102	109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012185	TA	3	6	114	119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012185	GAT	2	6	156	161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012185	TTA	2	6	175	180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012185	GTAA	2	8	1388	1395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012185	TAT	2	6	1411	1416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012185	TAT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012185	TAAT	2	8	1489	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012185	TAT	2	6	1497	1502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012185	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012185	TA	3	6	1514	1519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012185	CTT	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012185	TTA	2	6	1559	1564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012185	TTA	2	6	1592	1597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012185	TCTAG	2	10	1612	1621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012185	AAGGT	2	10	1622	1631	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012185	TAAA	2	8	1639	1646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012185	AAT	2	6	1659	1664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012185	TAA	2	6	1672	1677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012185	A	6	6	1686	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012185	AAAT	2	8	1739	1746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012185	ATA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012185	A	7	7	1799	1805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012185	TCAAA	2	10	1808	1817	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012185	TA	3	6	1857	1862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012185	AAC	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012185	TTA	2	6	1888	1893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012185	T	6	6	1901	1906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012185	ATT	2	6	1911	1916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012185	AAT	2	6	1964	1969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012185	TAGA	2	8	2007	2014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012185	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012185	TAA	2	6	2039	2044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012185	TAG	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012185	ATCTTA	2	12	2087	2098	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012185	TAAT	2	8	2099	2106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012185	TAC	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012185	AT	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012185	CAA	2	6	2147	2152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012185	AAT	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012185	TAA	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012185	TAT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012185	TA	3	6	2250	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012185	CAC	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_012185	TATC	2	8	2314	2321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012185	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012185	CTA	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012185	T	7	7	2359	2365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012185	A	7	7	2366	2372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012185	CAT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012185	ATT	2	6	2396	2401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012185	TAA	2	6	2441	2446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012185	CT	3	6	2448	2453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012185	CTT	2	6	2464	2469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012185	TA	4	8	2487	2494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012185	TGC	2	6	2592	2597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012185	TTA	2	6	2605	2610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012185	TTG	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012185	TTA	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012185	T	6	6	2710	2715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012185	ATA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012185	TTA	2	6	2749	2754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012185	ACA	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012185	T	6	6	2788	2793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012185	ATT	2	6	2820	2825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012185	T	6	6	2824	2829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012185	TAAT	2	8	2837	2844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012185	TGATT	2	10	2861	2870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012185	TTA	2	6	2872	2877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012185	ATT	2	6	2901	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012185	T	6	6	2943	2948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012185	TCC	2	6	2957	2962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012185	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012185	A	6	6	3025	3030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012185	T	8	8	3049	3056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012185	A	8	8	3071	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012185	TCG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012185	CTTTC	2	10	3116	3125	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_012185	ACT	2	6	3314	3319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012185	TAT	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012185	TTA	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012185	TAA	3	9	3446	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012185	TAG	2	6	3459	3464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012185	ATC	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012185	AAAT	2	8	3512	3519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012185	TAT	2	6	3527	3532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012185	TTA	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012185	AT	3	6	3678	3683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012185	AAAC	2	8	3719	3726	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012185	TC	3	6	3754	3759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012185	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012185	T	6	6	3828	3833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012185	A	7	7	3844	3850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012185	TAC	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012185	TATT	2	8	3921	3928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012185	ATC	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012185	TA	3	6	3960	3965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012185	TAA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012185	A	7	7	3977	3983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012185	TA	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012185	A	8	8	4009	4016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012185	TTA	2	6	4049	4054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012185	CAA	2	6	4087	4092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012185	A	8	8	4130	4137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012185	A	6	6	4151	4156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012185	GGATAT	2	12	4164	4175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012185	TAT	2	6	4179	4184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012185	AATGG	2	10	4191	4200	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012185	TAT	2	6	4272	4277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012185	TTA	2	6	4298	4303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012185	GTT	2	6	4341	4346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012185	TAAAT	2	10	4633	4642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012185	ATT	2	6	4678	4683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012185	AT	3	6	4742	4747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012185	T	7	7	4747	4753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012185	AGCTA	2	10	4754	4763	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012185	TAT	2	6	4776	4781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012185	TAT	2	6	4799	4804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012185	TTA	2	6	4823	4828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012185	AAT	2	6	4851	4856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012185	A	7	7	4862	4868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012185	T	6	6	4922	4927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012185	TAT	2	6	4934	4939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012185	TTACTT	2	12	4948	4959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012185	T	7	7	4975	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012185	CCA	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_012185	ACA	2	6	4993	4998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012185	ATT	2	6	5218	5223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012185	TTA	2	6	5240	5245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012185	TAA	2	6	5260	5265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012185	A	6	6	5275	5280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012185	ATA	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012185	CTTT	2	8	5330	5337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012185	AAG	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012185	TAA	3	9	5348	5356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012185	ATT	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012185	ATT	2	6	5396	5401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012185	AAT	2	6	5419	5424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012185	T	7	7	5443	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012185	AAG	2	6	5481	5486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012185	ATA	2	6	5492	5497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012185	ATCA	2	8	5672	5679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012185	AT	3	6	5683	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012185	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012185	AAT	2	6	5760	5765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012185	ATTA	2	8	5780	5787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012185	ATTA	2	8	5791	5798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012185	AAT	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012185	ATA	3	9	6698	6706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012185	AATTA	2	10	6745	6754	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012185	TAAA	2	8	6755	6762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_012185	A	6	6	15436	15441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_012185	T	6	6	15541	15546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_012185	T	6	6	15918	15923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_012185	TAAAT	2	10	15931	15940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_012185	ATTT	2	8	15972	15979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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353	NC_012185	ATT	2	6	19533	19538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_012185	TAAT	2	8	22903	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_012185	ATA	2	6	22920	22925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_012185	TAA	2	6	23011	23016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_012185	CAT	2	6	23045	23050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_012185	A	7	7	23052	23058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_012185	ATC	2	6	23077	23082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_012185	ATTA	2	8	23115	23122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_012185	TAA	2	6	23136	23141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_012185	TTA	3	9	23144	23152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_012185	GA	3	6	25462	25467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
460	NC_012185	ATATA	2	10	26109	26118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_012185	TTA	2	6	26119	26124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_012185	GTTAG	2	10	26129	26138	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
463	NC_012185	TC	4	8	26147	26154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
464	NC_012185	AGT	2	6	26162	26167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_012185	T	7	7	26189	26195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_012185	CTA	2	6	26200	26205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_012185	TTTC	2	8	26233	26240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
468	NC_012185	TAA	2	6	26253	26258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_012185	ATA	2	6	26296	26301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_012185	ATA	2	6	26307	26312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_012185	GAT	2	6	26456	26461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012185	AGTA	2	8	26492	26499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_012185	ATAA	3	12	26543	26554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_012185	TAC	2	6	26562	26567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_012185	T	8	8	26576	26583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_012185	A	6	6	26584	26589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_012185	AT	3	6	26598	26603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_012185	TTA	2	6	26633	26638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_012185	AAG	2	6	26651	26656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
480	NC_012185	ATTT	2	8	26665	26672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_012185	AATT	2	8	26704	26711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_012185	TAT	2	6	26770	26775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_012185	TAA	2	6	26916	26921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_012185	A	8	8	26920	26927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_012185	TAGAAA	2	12	26931	26942	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
486	NC_012185	A	7	7	26940	26946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_012185	AGAT	2	8	26968	26975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_012185	A	6	6	27047	27052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_012185	TCA	2	6	27076	27081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_012185	ATA	2	6	27126	27131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_012185	T	6	6	27143	27148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_012185	TTA	2	6	27152	27157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_012185	ATT	2	6	27166	27171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_012185	ATT	2	6	27187	27192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
495	NC_012185	CAA	2	6	27221	27226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
496	NC_012185	A	6	6	27225	27230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_012185	AAT	2	6	27255	27260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_012185	GATT	2	8	27267	27274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_012185	AAT	2	6	27304	27309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_012185	AAAG	2	8	27354	27361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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